Il Gruppo FFS è suddiviso nelle quattro Divisioni Viaggiatori, Merci (FFS Cargo), Infrastruttura e Immobili. A queste si aggiungono le funzioni di pilotaggio e di servizio, delle quali fanno parte tra gli altri le Finanze e la Gestione del personale.

La Direzione del Gruppo definisce i punti centrali di attività e gli obiettivi annuali per tutte le aree dell’azienda.